Como en el torneo pasado Colo-Colo se coronó campeón del torneo, estando un punto sobre Universidad Católica. Anotó su primer gol en el Torneo de Clausura 2006 29 de octubre del 2006 en el superclásico del fútbol chileno frente a la Universidad de Chile, a la cual vencieron 4-2. Al partido siguiente Sánchez anotó un doblete frente a Deportes La Serena, encuentro en que su equipo empató a cuatro.